В 22 веке Реплоиды стали обычным явлением после того, как доктор Кейн заново открыл старую лабораторию доктора Лайта и основал несколько проектов на основе оригинала доктора Лайта, названного Мегаман Х. Х. Тем временем, он присоединился к Охотникам Маверика, и работает с командиром отряда Зеро под командованием генерала Сигмы. Их задача - уничтожить негодяев Реплоидов, тех, кто стал агрессивным.